伴随着近些年显微镜脑外科在临床医学上的运用，大家对原发性三叉神经痛的发病原因拥有新的了解，对原发性三叉神经痛的诊断率明显增强。研究发现，三叉神经痛常由其隶属部位和相邻部位的各种各样疾病造成，如各种各样恶性肿瘤、发炎、毛细血管病变或毛细血管被压迫、蛛网膜粘连等。
一、脑干內部的病变
延髓及脑桥內部的病变，如脊髓空洞症、脑干肿瘤、毛细血管病变、多发性硬化症、发炎等。脑干内病变造成的三叉神经痛的痛疼特性和痛疼主要表现比不上继发性三叉神经痛典型性，痛疼常以延续性，一般伴随相对的病症和临床症状。
二、颅后窝的病变(三叉神经后根处的病变)
如桥丘脑角的恶性肿瘤(表皮样囊肿、神经鞘瘤、脑膜瘤等)、蛛网膜囊肿或粘连等，均可造成三叉神经痛的发病。在桥丘脑角中上端，三叉神经由桥脑传出根据桥丘脑角上端进到颅中窝，此部位是表皮样囊肿的多见于部位。肿瘤发生在三叉神经根周边，病发初期就可以累及三叉神经而出現同侧边部痛疼，而且经常为典型性的三叉神经痛。伴随着病况的进度，出現相邻部位的被压迫病症，可伴随三叉神经主产区的觉得和运动障碍，如脸部发麻、眼角膜迟钝。眼震电图对确诊继发性于桥丘脑角胆脂瘤三叉神经痛有一定实际意义。在桥丘脑角下端，三叉神经、听神经自桥脑传出，此部位的恶性肿瘤最普遍听神经瘤、脑膜瘤和表皮样囊肿。该类患者，常以耳呜、失聪、头昏等为先发病症，随肿瘤生长累及三叉神经后可出現三叉神经痛病症。
三、颅中窝病变
(一)颅中窝底后侧恶性肿瘤 该部位以脑膜瘤、三叉神经节神经纤维瘤、表皮样囊肿和颅底转移瘤多见，肿瘤生长累及坐落于Meckel囊内的三叉神经节，出現三叉神经痛病症。三叉神经纤维瘤多以一侧脸部发麻或延续性痛疼发病，可累及三叉神经第一、二支主产区，乃至拓展至一侧脸部、口腔粘膜、牙齿、舌前2／3和上下颚等处。
(二)颅中窝底前侧恶性肿瘤 以脑膜瘤、表皮样囊肿和颅底转移瘤多见。恶性肿瘤累及眶上裂、圆洞，出現相对病症。
四、三叉神经周边支病变
眶内的恶性肿瘤、蝶骨小翼区的恶性肿瘤、海绵窦的病变及眶上裂的病变，均可累及或侵害三叉神经根，造成原发性三叉神经痛。副鼻窦的病变及其牙源性的病变也可造成三叉神经痛，但痛疼一般不典型性，多主要表现为延续性隐疼。
